相关实验视频
Updated: Jul 16, 2025
13:00
Engineering Antiviral Agents via Surface Plasmon Resonance
Published on: June 14, 2022
2.4K
在Beta-27 Fab的计算重新设计中,与人类ACE2受体相比,对SARS-CoV-2 Omicron变异的结合亲和力预测要好得多
Wantanee Treewattanawong1, Thassanai Sitthiyotha1, Surasak Chunsrivirot2
1Structural and Computational Biology Research Unit, Department of Biochemistry, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Pathumwan, Bangkok, 10330, Thailand.
Scientific reports
|September 19, 2023
概括
研究人员增强了中和抗体片段 (Beta-27 Fab),以更好地结合SARS-CoV-2的Omicron变种. 计算设计产生了五种改进的抗体候选者,通过阻止病毒细胞进入,提供了潜在的新型COVID-19疗法.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) Omicron变种构成了全球健康的重大威胁.
- SARS-CoV-2受体结合域 (RBD) 结合了 ангиотензин转化酶2 (ACE2) 受体,以促进病毒进入人体细胞.
- 针对SARS-CoV-2-RBD-ACE2相互作用的中和抗体是关键的治疗策略.
研究的目的:
- 通过计算设计和增强Beta-27 Fab抗体片段与SARS-CoV-2 Omicron变异RBD的结合亲和力.
- 识别具有针对Omicron变种改善中和能力的新型抗体候选者.
主要方法:
- 计算式蛋白质设计被用于对Beta-27 Fab.的工程修改.
- 用分子动力学 (MD) 模拟来评估设计变体与Omicron RBD的结合亲和力.
- 分析了抗体变体和Omicron RBD之间的结合相互作用.
主要成果:
- 五种优化的Beta-27 Fab变种 (Beta-27-D01, -D03, -D06, -D09, -D10 Fabs) 与原始的Beta-27 Fab和ACE2相比,对Omicron RBD显著增强了结合亲和力.
- 增强的结合主要归因于抗体的CDR L2和L3区域内的相互作用增加.
- 设计的Fabs与Omicron RBD上的ACE2结合部位结合.
结论:
- 经过工程改造的Beta-27 Fab变体对SARS-CoV-2 Omicron RBD具有强烈的结合.
- 这些优化的抗体片段代表了破坏ACE2-Omicron RBD相互作用和打击COVID-19的有希望的治疗候选人.
