YTHDF3作为甲状腺癌的预后预测生物标志物及其与免疫透的相关性
Yihan Zhang1, Ying Chen2, Ruihua Chen1
1Department of Endocrinology and Metabolism, Center for Microbiota and Immunological Diseases, Shanghai General Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China.
BMC cancer
|September 19, 2023
概括
N6-甲基氨酸 (m6A) RNA甲基化调节剂在甲状腺癌 (TC) 中至关重要. YTHDF3被确定为TC的潜在预后生物标志物,影响其发展和免疫透.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 甲状腺癌 (TC) 发病率在全球范围内正在上升.
- N6-甲基氨酸 (m6A) RNA甲基化是一种调节基因表达的表观遗传机制.
- m6A调节器在各种癌症中发挥着重要作用,包括TC.
研究的目的:
- 确定甲状腺癌中m6ARNA甲基化调节者的特征和预测价值.
- 建立一个风险模型来预测基于m6A调节器的TC预后.
- 探索m6A调节器与TC中的免疫透之间的相关性.
主要方法:
- 来自TCGA数据库的RNA测序数据用于差异表达分析.
- 拉索-考克斯回归用于构建预后风险模型.
- 卡普兰-梅尔分析,ROC曲线,GSEA,IHC和qPCR用于验证和机制预测.
- TIMER数据库用于评估免疫细胞透相关性.
主要成果:
- 确定IGF2BP2,YTHDF1和YTHDF3是TC的独立预后因素.
- 基于整体存活率和临床特征,YTHDF3被选为潜在的预测因子.
- 通过IHC和qPCR在TC中差异性确认YTHDF3表达.
- YTHDF3表达与CD4+T细胞和巨细胞透和免疫标记物正相关.
结论:
- YTHDF3 作为甲状腺癌的潜在预后生物标志物.
- YTHDF3影响TC的开始和进展.
- 这项研究为甲状腺癌中m6ARNA修饰提供了新的见解.
