Xenomake:一个处理和分类的管道,从空间转录原子实验中读取异种移植的读数
Benjamin S Strope1,2, Katherine E Pendleton1,2,3, William Z Bowie1,2
1Lester and Sue Smith Breast Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|September 21, 2023
概括
Xenomake 是一个新的管道,用于处理空间异种移植数据. 它自动化了分析,改善了基因计数,并保持了瘤微环境研究的生物相关性.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 异种移植模型对于研究人类瘤生物学和瘤微环境中的药物反应至关重要.
- 空间解析的转录学 (SRT) 提供了对异种移植模型组织的有力见解.
- 缺乏专门的生物信息学管道来处理来自异种移植的SRT数据.
结论:
- Xenomake提供了一种自动化解决方案,用于分析异种移植模型中的SRT数据.
- 这条管道提高了数据质量,并促进了更深入的生物学见解.
- Xenomake支持对瘤微环境和药物反应的全面研究.
