识别新型金属β-乳酸酶抑制剂,使用基于联体的药模拟和基于结构的虚拟查
Mohammad Ezati1, Ali Ahmadi1, Esmaeil Behmard2
1Molecular Biology Research Center, Systems Biology and Poisonings Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|September 21, 2023
概括
这项研究通过计算查确定了两种新型候选药物,通过抑制金属β-乳糖酶 (MBLs),特别是IMP,VIM和NDM酶,以对抗多药耐药性感染.
科学领域:
- 药用化学 医学化学
- 计算生物学 计算生物学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 金属β-乳糖酶 (MBLs) 对关键的β-乳糖抗生素产生耐药性.
- IMP,VIM和NDM是临床显著的MBL酶组,驱动多药耐药性.
- 迫切需要新的抑制剂来克服MBL介导的抗生素耐药性.
研究的目的:
- 以计算方式识别针对IMP-1,VIM-2和NDM-1金属β-乳酸酶的新型抑制剂.
- 选一个大型的天然化合物库,寻找潜在的MBL抑制剂.
- 评估已识别的候选药物的药物相似性和结合性特征.
主要方法:
- 虚拟选一个拥有200,583个成员的自然图书馆与MBL活跃站点.
- 应用Lipinski的五项规则 (RO5) 和PAINS过器.
- 药模拟,共识对接,分子动力学 (MD) 和MM-PBSA计算.
- 用于评估化合物的ADMET分析.
主要成果:
- 一个计算工作流成功地将一个大型图书馆过到有前途的候选人.
- 两种强效的新型重叠抑制剂被确定为B1亚类MBLs.
- 选择的候选药物表现出良好的药物相似性和结合特性.
结论:
- 该研究成功确定了两种新型候选药物,它们有可能抑制关键的金属β-乳酸酶.
- 这些化合物代表了对抗多药耐药细菌的实验验证的有希望的线索.
- 计算工作流提供了一种有效的策略,用于发现新型抗生素耐药性抑制剂.
