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Updated: Jul 16, 2025
08:14
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Published on: January 21, 2013
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开放的叶子:一个开源的基于云的表型系统,用于跟踪动态变化在叶子特定的分辨率在Arabidopsis
Landon G Swartz1,2, Suxing Liu3, Drew Dahlquist1
1Department of Electrical Engineering and Computer Science, University of Missouri, 411 S 6th St., Columbia, Missouri, 65201, USA.
The Plant journal : for cell and molecular biology
|September 21, 2023
概括
我们开发了OPEN leaf,一个开源的植物表型系统,以应对在表征未分配的Arabidopsis基因方面的挑战. 这种可访问的技术可以对植物对环境变化的反应进行详细,高通量分析.
科学领域:
- 植物生物学 植物生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 超过30%的Arabidopsis基因由于冗余或致命性而没有表征.
- 高通量植物表型化 (HTPP) 可以揭示微妙的表型,但商业访问是有限的.
研究的目的:
- 设计和实施一个开源的HTPP系统 (开放的叶子) 可访问的植物基因功能研究.
- 证明系统在记录动态植物反应方面的能力.
- 突出VIS传感器在高通量选中的实用性.
主要方法:
- 开发开放的叶子系统与云连接和远程通信.
- 与SMART图像处理管道的集成.
- 使用VIS传感器进行叶子特定的,时间依赖的表型化.
主要成果:
- 开放的叶子成功地记录和量化了动态的整个花束和叶子特定的变化,以响应营养的可用性.
- 视觉信息系统传感器在识别以前未知的表型方面被证明是有效的.
- 该系统展示了模块化和传感器集成的方便性.
结论:
- 开放的叶子提供了一个可访问的,开源解决方案,用于高通量植物表型.
- 该系统有助于基因功能的表征,特别是冗余或必需基因.
- 进一步集成传感器可以扩大系统的研究应用.
