在老鼠DRG神经元中,Hprt作为qRT-PCR规范化的理想参考基因
Fenglan Liu1,2, Yang Miao3, Yaxian Wang1
1Key Laboratory of Neuroregeneration of Jiangsu and Ministry of Education; Co-innovation Center of Neuroregeneration, Nantong University, 226001 Nantong, Jiangsu, China.
Journal of integrative neuroscience
|September 21, 2023
概括
低氨酸基转移酶 (Hprt) 是大鼠背根 (DRG) 神经元中定量实时逆转录聚合酶连锁反应 (qRT-PCR) 的最稳定的参考基因. 这一发现对于神经系统疾病中精确的基因表达研究至关重要.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 精确的基因表达分析在老鼠背部根 (DRG) 神经元中对于理解神经系统疾病至关重要.
- 选择适当的参考基因对于定量实时逆转录聚合酶链反应 (qRT-PCR) 数据的可靠性至关重要.
研究的目的:
- 通过不同的发育阶段和治疗方法,识别和验证大鼠DRG神经元中的qRT-PCR最稳定的参考基因.
- 评估使用稳定基因与不稳定基因对目标基因表达分析的影响.
主要方法:
- 量化实时逆转录聚合酶链反应 (qRT-PCR) 在大鼠DRG神经元中的12个候选参考基因上进行.
- 用生物变异系数,geNorm和NormFinder算法来评估基因稳定性.
- 最多和最不稳定的基因被用作内部控制来分析它们对基因表达的影响.
主要成果:
- 参考基因表达在不同的条件下有显著的变化,18S核糖体RNA (Rn18s) 和β-actin (Actb) 显示出最大的波动.
- 乌比基C (Ubc),素基转移酶 (Hprt) 和线粒体核糖体蛋白L10 (Mrpl10) 的稳定性更高.
- Hprt被确定为最稳定的参考基因,而Actb是最不稳定的基因.
- 使用不稳定的参考基因 (Actb,Ankrd27) 导致结果的高变异性,影响了目标基因表达的确定.
结论:
- 低氨酸基转移酶 (Hprt) 是适合于老鼠DRG神经元中的qRT-PCR的内源参考基因.
- 选择Hprt为神经系统疾病研究中的遗传特征提供了可靠的分子基础.
- 这项研究强调了严格的参考基因验证对于准确的基因表达概况的重要性.
