使用现场杂交技术检测低水平的传染性SARS-CoV-2的协议
Andréa Cottignies-Calamarte1, Feifan He1, Aiwei Zhu1
1Laboratory of Mucosal Entry of HIV and Mucosal Immunity, Université de Paris Cité, Paris, France; Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université de Paris Cité, Paris, France.
STAR protocols
|September 22, 2023
概括
这项研究提出了一项新协议,用于检测临床样本中低水平的严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) RNA和蛋白质. 该方法使用流式细胞计和显微镜用于感染后几个月的敏感病毒检测.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 持续性严重急性呼吸道综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) RNA/蛋白质/病毒在感染后几个月可检测.
- 这种持久性可能与SARS-CoV-2变种或长期冠状病毒疾病 (长期COVID) 有关.
- 检测低病毒载荷对于了解持续感染和长期COVID至关重要.
研究的目的:
- 开发和介绍一项用于同时检测低水平的SARS-CoV-2RNA和蛋白质的协议.
- 为了使临床样本中持续存在的病毒的敏感量化和可视化.
- 提供适用于研究SARS-CoV-2变种和长期COVID的方法.
主要方法:
- 协议涉及与SARS-CoV-2的细胞感染.
- 使用光在现场杂交流细胞计 (FISH流细胞计) 的量化.
- 通过免疫标记和RNAscope技术进行可视化.
主要成果:
- 描述的协议有效地检测出低水平的病毒RNA和蛋白质.
- 鱼流细胞计可以进行敏感的量化.
- 免疫标记和RNAscope提供了病毒组件的详细可视化.
结论:
- 提出的协议提供了一种敏感的方法来检测持久的SARS-CoV-2.
- 这种方法直接适用于用于长期COVID研究的临床样本.
- 该技术有助于理解长期病毒存在的机制及其影响.


