在日本从猪身上分离出来的Actinobacillus pleuropneumoniae的表征,使用全基因组测序

科学领域:

• 兽医微生物学 兽医微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 动物卫生 动物健康

背景情况:

• pleuropneumoniae 是一个重要的猪病原体.
• 疫苗对新出现的血清型的疗效令人担忧.
• 了解遗传多样性对于疾病控制至关重要.

研究的目的:

• 研究病猪中Actinobacillus pleuropneumoniae分离物中的血清型,毒性和抗菌素耐药性 (AMR) 基因.
• 使用全基因组测序分析分离物之间的遗传关系.
• 评估AMR的流行率和遗传基础.

主要方法:

• 在Actinobacillus pleuropneumoniae孤立的全基因组测序.
• 基于核心基因组单核酸多形态 (SNP) 的血清型和遗传学分析.
• 抗微生物耐药性基因及其位置的识别和表征 (等离子体衍生).

主要成果:

• 血清型2是最常见的 (71.2%),但血清型6 (13.6%) 和15 (6.8%) 的患病率增加.
• 血清型6和15的分离物可能对当前的疫苗敏感性较低.
• 抗微生物药物耐药性基因,特别是四环素,在32.2%的分离物中被发现;耐药性表型和基因型相关.
• 等离子体衍生型的体含有各种AMR基因.

结论:

• 循环中的Actinobacillus pleuropneumoniae分离体表现出与疫苗菌株不同的遗传特性.
• 虽然存在一些AMR基因,但在这些隔离品中,广泛的抗微生物耐药性可能不是当前的问题.
• 监测新出现的血清型和AMR对于有效的猪病管理至关重要.