免疫光和成像质细胞计的双模式成像用于整片成像和精确的细分成像
Eun Na Kim1, Phyllis Zixuan Chen2, Dario Bressan3
1Department of Biomedical Engineering and Computational Biology Program, Oregon Health and Science University, Portland, OR, USA; Department of Pathology, Seoul National University Hospital, Seoul National University College of Medicine, Seoul, Republic of Korea.
Cell reports methods
|September 23, 2023
概括
这项研究引入了一种双模式成像方法,将高分辨率免疫光和成像质细胞计结合起来. 这种方法通过将小视野集成到整个幻灯片图像中,以进行详细的单细胞分析来增强空间表型.
科学领域:
- 生物医学成像技术 生物医学成像技术
- 计算病理学计算病理学
- 单细胞分析的方法
背景情况:
- 图像质细胞测量 (IMC) 能够实现高复杂度的空间表型化,但受到小视野 (FOV) 和低分辨率的限制.
- 目前的IMC限制阻碍了单细胞综合分析和组织样本的空间分析.
研究的目的:
- 开发一种双模式成像方法,将高分辨率免疫光 (IF) 与IMC集成在一起.
- 克服IMC的分辨率和FOV限制,以改善空间表型.
- 为了实现准确的单细胞细分和特征提取下游分析.
主要方法:
- 开发了一个计算管道,将高分辨率的IF整片图像 (WSIs) 与IMC数据集成在一起.
- IF WSIs 作为空间参考来重建高维的 IMC WSIs.
- 高分辨率的IF图像促进了精确的单细胞细分,以便进行强大的特征提取.
主要成果:
- 双模式方法成功地从小型FOV重建了WSI IMC图像.
- 使用高分辨率的IF数据实现了精确的单细胞细分.
- 该方法应用于食道腺癌,揭示了其单细胞病理景观.
结论:
- 开发的双模态成像策略显著提高了空间表型能力.
- 这种方法提供了对组织结构和细胞相互作用的更全面的理解.
- 它提供了一个实用的解决方案,用于将高维IMC数据与WSI分析集成在一起.
