对本地便指标和废水病原体病毒度技术的比较
1Department of Civil & Environmental Engineering & Earth Sciences, University of Notre Dame, 156 Fitzpatrick Hall, Notre Dame, IN 46556, United States.
The Science of the total environment
|September 23, 2023
概括
在废水中集中本地病毒对于检测至关重要. 艾米康波器方法显示出广泛的有效性,而聚乙烯糖醇沉 (PEG) 则在低滴度的SARS-CoV-2检测中表现出色,突出了对本地目标评估的需求.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 分析水质,分析水质.
背景情况:
- 环境水中的病毒病原体是稀释的,需要在分析前集中.
- 传统的度研究通常使用尖端控制,这可能不反映原生病毒行为.
研究的目的:
- 评估废水中的原生病毒标的四种度方法 (PEG,SMF,pH,Amicon).
- 为了比较本土病毒的恢复效率与非本土的spike-in对照.
- 为了确定各种病毒点的最有效的度方法.
主要方法:
- 测试了四种度方法:聚乙烯糖醇沉 (PEG),脱脂牛奶花 (SMF),通过过降低pH值,以及Amicon离心.
- 原生病毒标包括指标 (crAssphage,胡轻度斑点病毒) 和病原体 (腺病毒,诺罗病毒GII,人类多病毒,SARS-CoV-2),以及细菌标记 (HF183).
- 使用非本地尖端控制来评估恢复的准确性.
主要成果:
- 在目标和方法之间,恢复效率差异很大 (0.139.3%).
- 艾米康方法在整体恢复方面表现出最广泛的有效性.
- 对于低滴度的SARS-CoV-2,PEG沉产生了最高的检测率 (96.7%).
- 非本土增长率不准确地代表了本土复苏趋势.
结论:
- 度方法的效率因目标病毒和使用的方法而异.
- 艾米康方法在广义上是有效的,但对于特定的低滴度目标,如SARS-CoV-2,PEG沉是优越的.
- 评估与本地病毒标的度方法对于准确的环境水分析至关重要.
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