在厄瓜多尔的龙果中发现的Schlumbergera病毒X的发生,分布和种群结构

科学领域:

• 植物病毒学 植物病毒学
• 分子遗传学分子遗传学
• 农业昆虫学 农业昆虫学

背景情况:

• 施卢姆贝格拉病毒X (SchVX) 是一种影响龙果种植的植物病原体.
• 龙果 (Hylocereus* spp.) 的意思是龙果. 是厄瓜多尔的一个重要作物,其中*H. undatus*和*H. megalanthus*是主要物种.
• 之前的研究已经在其他地区发现了SchVX,但在厄瓜多尔的存在和遗传多样性是未知的.

研究的目的:

• 在厄瓜多尔的龙果田中识别和鉴定Schlumbergera病毒X (SchVX).
• 确定厄瓜多尔SchVX分离物与全球其他已知的分离物之间的遗传关系.
• 在厄瓜多尔调查SchVX的起源和引入途径.

主要方法:

• 在厄瓜多尔三个省份进行了实地调查,以收集龙果样本.
• 使用分子技术确认了病毒的存在,包括对依赖RNA的RNA聚合酶 (RdRp) 基因的测序.
• 用部分RdRp序列和全基因组比较进行了家族遗传分析.

主要成果:

• 在 *Hylocereus undatus* 和 *Hylocereus megalanthus* 的症状和无症状分类中检测到SchVX.
• 厄瓜多尔的SchVX分离物来自*H. undatus*和*H. megalanthus*,与来自西班牙和葡萄牙的分离物有共同的祖先.
• 在*Hylocereus polyrhizus*中确定了SchVX的一个独特的基因组系,这表明至少有两个独立的引入到厄瓜多尔.

结论:

• 在厄瓜多尔,SchVX是本土的,影响了关键的龙果物种.
• 遗传数据表明,厄瓜多尔和欧洲的SchVX分离物有共同的起源.
• 有证据表明,SchVX在厄瓜多尔被多次引入,这凸显了严格的生物安全措施的必要性.