早期的Trichoderma virens的转录组反应对玉米根的殖民化
James T Taylor1, Ken-Der Wang1, Benjamin Horwitz2
1Department of Plant Pathology and Microbiology, Texas A&M University, College Station, TX, United States.
Frontiers in fungal biology
|September 25, 2023
概括
皮虫 (Trichoderma virens) 使用特定的基因进行植物根殖民. 该研究确定Sir1是这个过程中的关键调节者,揭示了理解真菌共生的新目标.
科学领域:
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 植物与微生物的相互作用
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 病毒性是一种有益的真菌,以生物控制而闻名.
- 它通过殖民根,与植物建立共生关系.
- 成功的殖民需要宿主沟通和克服植物防御.
研究的目的:
- 为了识别参与Trichoderma virens宿主通信和根植殖的基因.
- 了解特定基因 (Sm1和Sir1) 在这种相互作用中的作用.
- 开发用于识别与殖民有关的基因的新方法.
主要方法:
- 在玉米根殖民期间对野生类型的T. virens和删除突变体进行转录基因分析.
- 基因表达的时间过程分析.
- 开发一种基因聚类和联合表达网络分析算法.
主要成果:
- 基因表达在注射后24小时达到峰值,这表明植物微生物通信的关键窗口.
- 鉴定出Sir1基因,而不是Sm1,是对玉米真菌反应的主要调节者.
- 这种新的算法比以前的方法发现了40%更多的潜在殖民基因.
结论:
- Sir1在调节Trichoderma virens与玉米根的相互作用方面发挥着至关重要的作用.
- 早期的殖民化涉及与信号转导和代谢相关的基因表达的显著转变.
- 开发的算法提供了一种更全面的方法来识别真菌殖民中的关键基因.
