使用基于社区的繁殖计划 (CBBP) 模型作为一个协作平台,开发非洲山羊改进网络图像收集协议 (AGIN-ICP) 用移动技术收集和管理牲畜表型的数据
M Jennifer Woodward-Greene1,2,3, Jason M Kinser4, Heather J Huson5
1National Agricultural Library, USDA Agricultural Research Service, Beltsville, MD, United States.
Frontiers in genetics
|September 25, 2023
概括
非洲山羊改进网络图像收集协议 (AGIN-ICP) 提供了一种低成本,用户友好的方法,可以使用数字图像收集山羊表型数据. 该协议通过有效提供可靠的表型数据,有助于基因改进和保护工作.
科学领域:
- 动物科学动物科学
- 生物技术是生物技术.
- 农业工程 农业工程
背景情况:
- 现型数据收集对于动物遗传改进和保护至关重要.
- 现有的方法可能是昂贵的,耗时的,或需要专门的设备.
- 数字成像为有效和可访问的数据收集提供了一个有希望的途径.
研究的目的:
- 开发和验证非洲山羊改善网络图像收集协议 (AGIN-ICP).
- 建立一个低成本,用户友好的程序,使用数字图像收集山羊表型数据.
- 评估该协议是否适用于各种生产和采样条件.
主要方法:
- 在12个国家,AGIN-ICP在三年内进行了代开发和现场测试.
- 使用标准摄像头和移动设备收集了超过12,000张数字图像.
- 使用精确边缘图像分割算法 (PE-ISA) 对手工测量进行数字身体测量的验证.
主要成果:
- AGIN-ICP可以提取各种表型指标,包括健康指标,身体测量和外套特征.
- 数字体测量 (身高,长度,周长) 与手工测量有很强的相关性 (r=0.931,0.943,0.893).
- 该协议是针对成本,方便性和速度进行优化,而不会影响图像数据质量.
结论:
- AGIN-ICP是一种可行的,具有成本效益的工具,用于收集山羊的高质量表型数据.
- 该协议可以支持基于社区的育种计划和遗传资源保护.
- 仔细遵守协议步骤至关重要,以避免数据丢失或不适合分析.
