一种用于识别虫生物型特定的唾液效应体候选者的方法

科学领域:

• 昆虫学 昆虫学是一门学科.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 宿主在多虫虫中的专业化是常见的,但基本的分子机制是不太了解的.
• 生物型特定的唾液效应物被假定可以确定虫中的宿主特异性.

研究的目的:

• 为了确定生物型特定的唾液效应因子候选者,马尔瓦氏 (MA) 和属 (CU) 专业的棉花瓜, *Aphis gossypii* 的生物型.
• 调查效应体识别中的转录组和蛋白组数据之间的差异.

主要方法:

• 整个虫和虫头RNA测序 (RNA-seq) 以识别差异表达基因 (DEG).
• 对虫唾液进行定量蛋白质组分析,以确定唾液蛋白质.
• 组合分析整合RNA-seq和蛋白质组数据以确定效应体候选物.
• 对已识别的效应因子候选物的RT-qPCR验证.

主要成果:

• RNA-seq识别了数百个DEG,其中一个子集被认为是可能的效应因子.
• 蛋白质组分析显示,唾液中有44种不同丰富的蛋白质,但它们相应的基因没有显示出差异性表达.
• 结合了转录组和蛋白组数据的组合策略,成功确定了11个效应体候选物.
• 这11个候选物体的表达差异通过RT-qPCR得到证实.

结论:

• 一种结合的转录组和蛋白组方法是有效的,以确定生物型特异的效应体候选人在Aphis gossypii*.
• 这种策略具有很大的潜力,可以在其他吸水昆虫中发现效应因子.
• 了解这些作用因子可以揭示虫宿主专业化的机制.