用于下游遗传工作的皮肤剪片获得的Onchocerca volvulus微细菌的处理和储存程序

科学领域:

• 寄生虫学的寄生虫学
• 分子生物学分子生物学
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 消除瘤病是一种全球卫生优先事项,针对的是寄生虫*Onchocerca volvulus*.
• 对 *O. volvulus* 种群遗传分析对于优化干预策略和监测至关重要.
• 有效的基因分析需要高质量的寄生虫样本,适合分子分析.

研究的目的:

• 开发和评估用于大规模对*Onchocerca volvulus*进行遗传研究的微细菌转移程序.
• 提高适合从皮肤切片进行基因分析的微细菌的质量和数量.
• 为了促进准确的元数据分配,并最大限度地减少在瘤病研究中的资源使用.

主要方法:

• 开发一种用于处理皮肤切片样本的新型微细菌转移程序.
• 在南苏丹和刚果民主共和国 (DRC) 的样本中比较了微生物质量和qPCR测定成功率.
• 研究储存条件,特别是乙醇度,对微生物群的完整性.

主要成果:

• 开发的微细菌转移程序旨在增加可用于遗传分析的活力微细菌的百分比.
• 与南苏丹 (35.7-39.5%) 相比,来自刚果民主共和国的微细菌在qPCR测定中显示出明显较低的失败率 (16.0-16.7%).
• 储存期间较低的乙醇度 (64%) 与较高度 (≥75%) 相比,与更高的微细菌失败率有关.

结论:

• 微细菌转移程序是增强在瘤病消除计划中的遗传研究的一个有价值的工具.
• 优化样本采集和储存,特别是乙醇度,对于成功的*O. volvulus*遗传分析至关重要.
• 需要进一步的研究,以充分阐明影响微菌的生存能力和不同地理区域的测试成功率的因素.