多品种宿主皮表皮转录组和微生物组的关联及其与肉牛料效率的关系
P A S Fonseca1, S Lam1, Y Chen2
1Centre for Genetic Improvement of Livestock, Department of Animal Biosciences, University of Guelph, Guelph, ON, N1G 2W1, Canada.
Scientific reports
|September 27, 2023
概括
研究人员探索了牛群中的宿主微生物相互作用,将肠微生物与宿主基因表达联系起来,以提高料效率. 这可能使得更好的肉牛生产特征的遗传选择成为可能.
科学领域:
- 动物科学动物科学
- 基因组学就是基因组学.
- 微生物学 微生物学
背景情况:
- 皮中的宿主微生物相互作用对于牛的生产特征至关重要.
- 了解这些相互作用可以通过微生物群操纵或遗传选择来提高料效率.
研究的目的:
- 调查肉牛品种的宿主基因表达和乳头微生物丰富度之间的相关性,这些品种对残留料摄入 (RFI) 不同.
- 识别与料效率相关的候选基因和微生物种群.
主要方法:
- 皮组织的RNA测序和16S rRNA基因片测序被采用.
- 进行了差异基因表达和微生物丰度分析.
- 斯皮尔曼相关性被用来确定宿主基因和微生物ASVs之间的显著关联.
主要成果:
- 在宿主基因表达和骨古生物和细菌之间发现了显著的相关性.
- 与细菌ASVs相关的基因与肌肉收缩和免疫系统调节有关.
- 在Angus,Charolais和Kinsella品种中确定了料效率的候选基因.
结论:
- 这项研究提供了对影响肉牛料效率的宿主-菌体相互作用的见解.
- 已识别的宿主和微生物特征可以被定位为提高料效率的养殖牛.
