在呼吸系统疾病期间使儿科鼻腔洗的甲醇固定成为可能,用于与新鲜样本相比单细胞测序

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 分子生物学分子生物学
• 儿科 儿科 儿科

背景情况:

• 下呼吸道感染 (LRTI) 是全球主要的死亡原因之一,特别是在儿童中.
• 在感染的初始部位上呼吸道粘膜的免疫反应还不太清楚.
• 获取下呼吸道样本是侵入性的,与易于收集的鼻 (NW) 样本不同.

研究的目的:

• 开发和验证一项用于单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 的协议,使用来自LRTI儿童的甲醇固定鼻水样本.
• 评估使用NW样本在儿科呼吸道感染中进行详细免疫分析的可行性.

主要方法:

• 进行了一项试点研究,使用诊断为LRTI的住院儿童的鼻水样本.
• 开发了一种协议,用于在甲醇固定的NW样本上执行scRNA-seq.
• 在甲醇固定的和新鲜的NW样本之间比较了scRNA-seq的定性和定量参数.

主要成果:

• 在甲醇固定和新鲜NW样本之间的scRNA-seq定性和定量参数中没有观察到显著差异.
• 甲醇固定有效地保持了用于scRNA-seq分析的NW样本的完整性.

结论:

• 一个新的,有效的协议使得使用甲醇固定的儿科鼻样本的scRNA-seq分析成为可能.
• 这种方法克服了与临床样本采集相关的挑战,提供了处理灵活性.
• 该协议促进了多中心合作,用于研究儿科呼吸道感染.