化学信息学和机器学习方法来评估富勒烯衍生物的水生毒性概况
Natalja Fjodorova1, Marjana Novič1, Katja Venko1
1Laboratory for Chemoinformatics, Theory Department, National Institute of Chemistry, Hajdrihova 19, 1001 Ljubljana, Slovenia.
International journal of molecular sciences
|September 28, 2023
概括
富勒烯衍生物 (FDs) 对水生生物构成风险. 本研究确定了FDs影响水生生物的结构特征,有助于更安全的制造和环境保护.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 纳米材料的安全性
- 计算化学是一种计算化学.
背景情况:
- 富勒烯衍生物 (FDs) 在各种行业中使用,包括纳米材料,制药和生物医学.
- 评估FD对环境的影响,特别是对水生生态系统的影响,至关重要.
- 现有的毒性评估方法可能是复杂和耗时的.
研究的目的:
- 评估169种富勒烯衍生物 (FDs) 对水生环境的潜在毒性影响.
- 确定FD的特定结构特征,这些特征有助于水生物质的毒性.
- 开发用于评估FD水中毒性的预测模型,以促进更安全的制造决策.
主要方法:
- 来自蛋白质数据库 (PDB) 的169个FD与10种与水生物种蛋白质有很高相似性的人类蛋白质的结合亲和力分析.
- 评估FDs对乙胆酶 (AChE) 的结合活性,这是已知的水生毒素标.
- 使用ToxAlert用于结构性水生有毒性警报,以确认作用机制.
- 机器学习和化学信息学工具的应用,包括反传播人工神经网络 (CPANN) 和定量结构-活动关系 (QSAR) 模型.
主要成果:
- 通过使用CPANN模型,确定了FD与水生有毒性相关的蛋白质的关键结合特性.
- 预测未知FD的结合亲和力,减少了广泛实验测试的需要.
- 确定了FD的哪些结构特征对水生生物产生最重要的影响.
结论:
- 该研究为FD水生毒性的结构性决定因素提供了关键的见解.
- 这些发现可以指导开发FD的优先级,并为制造过程提供信息,以尽量减少环境风险.
- 预测建模提供了一种更有效的方法来评估FDs的生态毒理学概况.
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