在Nash到HCC的进展中阐明与cuproptosis相关的基因,使用批量和单细胞RNA测序分析和实验验证
Zizuo Zhao1, Tiankuo Luan2, Jingyuan Wan3
1Department of Anesthesiology, The First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University, Chongqing 400016, China.
Medicina (Kaunas, Lithuania)
|September 28, 2023
概括
这项研究确定了与cuproptosis相关的关键基因 (CRG),如FDX1,在非酒精性脂肪肝炎 (NASH) 进展到肝癌 (HCC) 中至关重要. 准FDX1可能有助于防止NASH发展为HCC.
科学领域:
- 肝病学和癌症生物学
- 细胞死亡机制 细胞死亡机制
背景情况:
- 非酒精性脂肪肝炎 (NASH) 是肝细胞癌 (HCC) 的一个主要危险因素.
- 质亡是一种新的细胞死亡途径,可能会影响疾病的进展.
- 在NASH的早期干预对于预防HCC发展至关重要.
研究的目的:
- 研究与cuproptosis相关的基因 (CRG) 在NASH向HCC进展中的作用.
- 确定与NASH相关的关键CRG及其过渡到HCC.
- 探索潜在的治疗目标,以预防NASH诱导的HCC.
主要方法:
- 利用了转录组和单细胞测序数据.
- 采用了非负矩阵因子化和加权相关联网络分析算法.
- 在小鼠模型和人类NASH样本中验证了基因表达.
主要成果:
- 在NASH中确定了FDX1,LIPT1,PDHP作为CRGs;在NASH中确定了FDX1,DBT,GCSH,SLC31A1,DLAT.
- FDX1在NASH及其向HCC的进展中发挥着重要作用.
- 在NASH患者和模型中,FDX1表达显著增加.
结论:
- 关键的CRG,特别是FDX1,与NASH及其向HCC的进展有关.
- CRG与NASH和HCC中的脂肪酸代谢和PPAR信号通路有关.
- 准FDX1是一个潜在的策略,可以抑制NASH进展到HCC.
