在男性生殖器样本中广泛检测HPV,使用目标丰富全基因组测序
Tengguo Li1, Elizabeth R Unger1, Mangalathu S Rajeevan1
1Division of High-Consequence Pathogens & Pathology, Centers for Disease Control and Prevention, 1600 Clifton Road, Atlanta, GA 30329, USA.
Viruses
|September 28, 2023
概括
这项研究揭示了男性生殖器样本中人类乳头瘤病毒 (HPV) 类型的巨大多样性,远远超过之前的监测. 丰富全基因组测序 (eWGS) 测定确定了众多已知和新型的HPV类型,突出了更广泛的检测方法的需要.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 基因组学就是基因组学.
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 人类乳头瘤病毒 (HPV) 监测通常集中在少数已知的类型上.
- 全范围的HPV多样性,特别是男性生殖器样本,仍然是不够的.
研究的目的:
- 评估丰富全基因组测序 (eWGS) 试验在男性生殖器样本中检测所有已知的和新型HPV类型的实用性.
- 为了评估男性生殖器样本的试点队列中的HPV类型多样性.
主要方法:
- 在50个男性生殖器样本上应用最近开发的eWGS试验.
- 综合测序和分析以识别所有存在的HPV类型,包括新型和未分类类型.
主要成果:
- 在82%的样本中检测到HPV,平均每样本有13.6种类型 (范围为1-85).
- 总共有560个HPV检测,包括237个独特的HPV类型 (46个α,55个β,135个gamma,1个mu).
- 发现了一种新型的玛型 (HPV229) 和90种未经分类的类型,高风险的α型不常见.
结论:
- eWGS测定对广泛的HPV类型检测是有效的,揭示了男性的类型多样性比以前更高.
- 需要进一步的研究,以了解这种广泛的HPV多样性在男性中的含义.


