轻度脱水对小鼠脏单核转录组和染色质可访问性的影响
Nha Van Huynh1, Cassidy Rehage1, Kelly A Hyndman1
1Section of Cardio-Renal Physiology and Medicine, Division of Nephrology, Department of Medicine, University of Alabama at Birmingham, Birmingham, Alabama, United States.
American journal of physiology. Renal physiology
|September 28, 2023
概括
在小鼠中,轻度脱水会导致显著的细胞特异性基因表达和染色质变化. 这些转录基因变化在性别之间存在差异,突出了维持液体平衡的各种机制.
科学领域:
- 脏生理学和分子生物学
- 基因组学和表观基因组学
- 基于性别的生物学反应差异.
背景情况:
- 每天轻度脱水可以增加血的度,触发血管压素的释放.
- 虽然已知收集管的主要细胞对脱水的反应,但更广泛的细胞变化仍未得到充分研究.
- 研究细胞特异性转录组和染色质可访问性变化,可以更深入地了解适应.
研究的目的:
- 为了研究轻度脱水对脏转录组和各种细胞类型的染色质可访问性的影响.
- 为了识别脏脱水的性别特异性分子反应.
- 探索基因表达和脱水期间染色质可访问性变化之间的关系.
主要方法:
- 在小鼠脏上使用单核多原子测序 (sn-multiome-seq) 和散装RNA测序.
- 从轻度缺水的小鼠与对照小鼠 (ad libitum水和食物) 的脏进行了比较.
- 分析了33个注释集群中的19,837个核,重点关注差异表达的基因和染色质可访问性.
主要成果:
- 轻度脱水显著增加了细胞的血度和基因表达的改变,包括增加了收集管道主要细胞中的aquaporin 2和3.
- 确定了新的脱水反应基因,如格雷姆林2 (Grem2) 和CREM转录因子结合动机的可访问性增加.
- 揭示了数百种性别和脱水特异性的差异表达基因,男性在脂质代谢中表现出丰富,女性在有机酸代谢途径中表现出丰富.
结论:
- 轻度脱水会导致脏中广泛的,细胞特异的转录组和染色质可访问性变化.
- 在基因表达对脱水的反应中存在显著的性别特异,这表明有不同的调节机制.
- 这些发现强调了脏液平衡调节的复杂性,并强调了在生理学研究中考虑性别的重要性.
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