通过可解释的机器学习模型,推进非典型和形脑膜瘤的个性化预后
Mert Karabacak1, Pemla Jagtiani2, Alejandro Carrasquilla1
1Department of Neurosurgery, Mount Sinai Health System, New York, NY, USA.
Journal of neuro-oncology
|September 28, 2023
概括
机器学习模型预测了非典型和形脑膜瘤的存活率. 使用TabPFN模型的Web应用程序为这些脑瘤患者提供了改进的风险评估.
科学领域:
- 神经瘤学神经瘤学
- 医疗信息学 医疗信息学
- 机器学习 机器学习
背景情况:
- 异常性 (世卫组织II级) 和形性 (世卫组织III级) 脑膜瘤是具有可变预后的侵袭性脑瘤.
- 准确的生存预测对于有效的患者管理和治疗规划至关重要.
研究的目的:
- 开发和部署机器学习 (ML) 模型,用于预测世卫组织II级和III级脑膜瘤患者的生存结果.
- 创建一个用户友好的 Web 应用程序,整合这些预测模型.
主要方法:
- 一项回顾性队列研究利用了来自国家癌症数据库 (NCDB) 的12,197名患有世卫组织II级和III级脑膜瘤的成年患者的数据.
- 使用Optuna库训练和优化了五个ML算法 (TabPFN,TabNet,XGBoost,LightGBM,Random Forest).这些算法使用了Optuna库进行训练和优化.
- 选择了表现最好的模型,将其部署在基于Web的应用程序中,以预测12个月,36个月和60个月的死亡率.
主要成果:
- TabPFN算法在所有时间点预测死亡率方面表现出卓越的表现.
- 在TabPFN模型中,接收器操作特征 (AUROC) 下的面积值为0.805 (12个月),0.781 (36个月) 和0.815 (60个月).
- 该数据集包括12,197名患者 (56.1%为女性,平均年龄为61岁).
结论:
- 机器学习模型是预测高度脑膜瘤患者生存结果的宝贵工具.
- 开发的Web应用程序为风险分层和预后评估提供了一个实用的平台.
- 可解释的ML模型可以增强神经瘤学中的临床决策.
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