通过FAIMS内部碎片化识别假阳性糖
Valentina Rangel-Angarita1, Keira E Mahoney1, Catherine Kwon1
1Department of Chemistry, Yale University, 275 Prospect Street, New Haven, Connecticut 06511, United States.
高场不对称波形离子运动谱法 (FAIMS) 帮助O-糖蛋白分析,但导致FAIMS内部碎片化 (IFF). 这种碎片化增加了光谱匹配,但可能会限制FAIMS在O-glycoproteomics中的应用性.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 分析化学 分析化学
- 葡萄糖科学 (Glycoscience) 是一种科学.
背景情况:
- 高场不对称波形离子流动性光谱法 (FAIMS) 是一种气相分离技术,在质谱法 (MS) 之前使用.
- FAIMS在增强糖的检测方面表现有前途,特别是对于N-糖化.
- 它的应用在O-糖蛋白和粘素域糖蛋白分析上仍然不太被探索.
研究的目的:
- 评估FAIMS在不同样本复杂度中分析O-糖蛋白和粘素域糖蛋白的实用性.
- 在此背景下调查与FAIMS分离相关的潜在挑战和现象.
主要方法:
- 用FAIMS分离,对含有O-糖蛋白和粘素域糖蛋白的不同复杂性的样本进行了分离.
- 分析了数据,以评估FAIMS对糖标识的影响.
- 特别研究了FAIMS内部碎片化 (IFF) 的发生和影响,并与对照实验进行了比较.
主要成果:
- 在FAIMS中,糖基化物种的识别增加,特别是在更复杂的样本中.
- 在分离过程中观察到一种称为"在FAIMS碎片化" (IFF) 的现象.
- 与对照组相比,IFF导致光谱匹配量增加了2到5倍,这一发现与以前的数据一致.
结论:
- FAIMS对于分析复杂的O-糖蛋白和粘素域糖蛋白样本可能是有益的.
- 在FAIMS分离过程中IFF的普遍发生需要仔细解释数据.
- IFF可能会对FAIMS在O-glycoproteomics的更广泛应用造成限制.
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