杆菌是可以吃的sp. nov. 从表面海水中分离出来
Kei Kitahara1, Basilua Andre Muzembo2, Sho Morohoshi3
1Graduate School of Medicine, Dentistry and Pharmaceutical Sciences, Okayama University, Okayama, Japan. keikitahara@okayama-u.ac.jp.
一种新的黄色细菌,Flavobacterium okayamense sp. 这是一种新的黄色细菌. 11月,在日本的小岛湾被发现. 这种格拉姆阴性细菌代表了Flavobacterium属内的新物种,扩大了我们对海洋微生物多样性的理解.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 细菌学 细菌学是一门学科.
- 海洋生物学 海洋生物学
背景情况:
- 菌 (Flavobacterium) 属包括在各种环境中发现的多种格兰负菌.
- 识别和描述新型细菌物种对于理解微生物生态系统及其功能至关重要.
研究的目的:
- 从表面海水中分离和鉴定一种新型细菌菌株.
- 确定该新型分离物与已知的Flavobacterium物种的遗传学和基因组相关性.
- 在Flavobacterium属内正式提出一种新物种.
主要方法:
- 从表面海水样本中分离细菌.
- 使用16S rRNA基因测序进行的家族遗传学分析.
- 整基因组猎枪测序用于平均核酸标识 (ANI) 和基因DNA-DNA杂交 (dDDH) 计算.
- 对细胞脂肪酸组成和DNA G+C含量的分析.
主要成果:
- 一种格拉姆阴性,黄色的殖民地形成细菌,菌株KK2020170 T,被隔离到日本的小岛湾.
- 遗传学分析表明,KK2020170 T菌株属于Flavobacterium属,F. haoranii LQY-7 T是其最近的亲属 (98.1%的16SrRNA基因相似性).
- 基因组分析显示,ANI (81.3%) 和dDDH (24.6%) 的值低于物种划分的门值,支持其新性. 关键的脂肪酸包括iso-C15:0,iso-C17:0 3-OH和iso-C15:1 G,其中menaquinone MK-6作为主要的呼吸道. DNA G+C 含量为 31.1% 的摩尔%.
结论:
- 菌株KK2020170 T代表了Flavobacterium属中的一种新物种.
- 这种新物种的拟议名称是Flavobacterium okayamense sp. 在新的一年里.
- 该类型菌株是KK2020170 T (ATCC TSD-280 T = NBRC 115344 T).该菌株的类型是KK2020170 T.
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