在果果的Russet诱导过程中,转录组的变化的时间过程
Jannis Straube1,2, Shreya Suvarna1, Yun-Hao Chen2
1Institute of Plant Genetics, Molecular Plant Breeding Section, Leibniz University Hannover, Herrenhäuser Straße 2, 30419, Hannover, Germany.
BMC plant biology
|September 29, 2023
概括
果中的腐蚀是由水分触发的,导致皮质微裂和随后的外皮形成. 这项研究揭示了在拉塞特发育期间早期基因表达的变化,为水果表面反应提供了洞察力.
科学领域:
- 植物科学 植物科学
- 分子生物学分子生物学
- 发展水果发展水果发展
背景情况:
- 在水果作物中,腐蚀是重要的问题,对质量产生负面影响.
- 精确的分子触发器的Russet启动仍然在很大程度上是未知的.
- 诸如受伤和暴露于水分等环境因素是已知的生的原因.
研究的目的:
- 为了研究果的早期分子事件,在果中形成罗塞特.
- 确定关键的基因和途径,涉及皮膜微裂和外皮发育.
- 在受控Russet诱导的非常早期阶段分析转录组变化.
主要方法:
- 使用双相湿度暴露技术在果中进行受控的色诱导.
- 高分辨率的转录组分析以识别差异表达的基因.
- 针对性基因表达分析最早在拉塞特诱导后24小时.
主要成果:
- 湿度暴露 (第一阶段) 降低了皮质合成基因 (例如,SHN3) 和增加了非生物应激基因,其中NAC35和MYB17是早期反应者.
- 周皮形成 (第二阶段) 涉及增加的系统活性基因 (例如,WOX4,MYB84) 和素/素合成基因 (例如,MYB52,MYB93).
- 第二阶段早期的基因表达模式与受伤后观察到的基因表达模式相似,表明共享的分子通路.
结论:
- 这项研究提供了第一个高分辨率的转录基因数据,记录了果中立即发生的罗塞特形成事件.
- 确定了关键基因 (例如,WOX4,AP2B3),与早期外皮形成和皮肤层微裂有关.
- 这些发现为化的时空动态提供了关键的见解,包括皮质合成,细胞脱差和细胞壁修饰.
