通过使用改进的样本预处理方法消除DNA放大抑制剂,在初级生产样本中快速检测沙门氏菌
Aaydha Chidambara Vinayaka1, Than Linh Quyen2, Van Ngoc Huynh2
1Laboratory of Applied Micro and Nanotechnology (LAMINATE), DTU-Bioengineering (Department of Biotechnology and Biomedicine), Technical University of Denmark, Kgs. Lyngby, Denmark.
Microbial biotechnology
|September 30, 2023
概括
一种新的兽医点照顾 (POC) 设备,VETPOD,使用循环介导同热放大 (LAMP) 来检测牲畜样本中的敏感沙门氏菌. 这种方法简化了像便这样复杂的矩阵中的现场病原体检测.
科学领域:
- 兽医微生物学 兽医微生物学
- 分子诊断学 分子诊断学
- 食品安全 食品安全
背景情况:
- 敏感病原体的检测对于欧盟"健康计划"行动计划至关重要.
- 复杂的畜牧生产样本需要现场测试设备.
- 由于复杂的准备,便样本对分子检测具有重大挑战.
研究的目的:
- 开发和调整一个循环介导的基于异热放大 (LAMP) 的兽医点照顾 (POC) 设备 (VETPOD),用于检测沙门氏菌.
- 评估不同采样方法 (便,靴,灰尘) 适用于现场测试的适用性.
- 为了优化样本准备,以抑制复杂矩阵中的放大.
主要方法:
- 开发基于LAMP的兽医医疗点 (POC) 设备 (VETPOD).
- 测试三种样本类型:半湿的便,靴和家禽棚灰尘.
- 优化两步离心和洗方法,从便基质中去除抑制剂.
主要成果:
- VETPOD显示出高灵敏度: 90%用于靴,84.62%用于便,81.82%用于尘埃样本.
- 相对检测水平 (RLOD) 为2.23 CFU/25g,略高于ISO 6579:1参考方法.
- 该VETPOD显示出与ISO 6579:1标准方法的良好一致.
结论:
- 该VETPOD是对现场沙门氏菌的有希望的替代方案. 在初级生产和畜牧业样本中检测.
- 优化的样本准备方法对于克服矩阵抑制至关重要.
- 该设备有助于敏感和快速的病原体检测,支持动物健康和食品安全倡议.
