一种常见的良性内在缺失,掩盖了一种致病性深层内在PCCB变体 - - 基因组测序和RNA研究来救援
Alina Kurolap1, Dalit Barel1, Nava Shaul Lotan2
1The Genetics Institute and Genomics Center, Tel Aviv Sourasky Medical Center, Tel Aviv, Israel.
Molecular genetics and metabolism
|September 30, 2023
概括
亲酸性血 (PA) 诊断是具有挑战性的,因为伪同卵性. 综合基因组和RNA分析发现了深层内基因变异,克服了关键患者护理的外基因组测序限制.
科学领域:
- 遗传学和基因组学 遗传学和基因组学
- 生物化学 生物化学
- 代谢障碍 代谢障碍 代谢障碍
背景情况:
- propionic acidemia (PA) 是一种自体递归代谢障碍,影响氨基酸和脂肪酸代谢.
- PA是由PCCA或PCCB的变异引起的,导致有毒代谢物积累和严重的健康后果.
- 肺炎的临床表现是可变的,通常在新生儿或婴儿期早期表现出来.
研究的目的:
- 调查PA病例的诊断挑战,其中初始外体序列测序 (ES) 无法识别致病变体.
- 证明整合基因组测序 (GS) 和RNA分析用于诊断复杂遗传疾病的实用性.
- 强调在遗传分析中考虑内基缺失的重要性,以避免对同卵性错误解释.
主要方法:
- 对受影响的个体进行了exome测序 (ES).
- 基因组测序 (GS) 在ES不确定的情况下被采用.
- 进行了RNA分析,以确认已识别的变种的致病性,并了解它们的功能影响.
主要成果:
- 在受影响的个体中,GS在同卵性状态中发现了深度内在PCCB变异.
- RNA分析显示,内基变异产生了具有过早停止子的伪exon,证实了病原性.
- 伪同胞性是由于父母中第二个等位基因的常见良性内基缺失导致的,使初始变异解释复杂化.
结论:
- 结合GS和RNA分析的综合遗传研究是诊断PA的强大工具,克服了ES的局限性.
- 应该仔细评估深层内在变异及其对拼接的影响,特别是在明显的父母同卵性病例中.
- 准确和快速的基因诊断对于及时干预,患者管理和生殖规划至关重要.
