使用内核流细胞计在隔离的小鼠大脑微质中量化全球质子后翻译修饰
Morgan Towriss1, Jennifer Kim2, Annie Vogel Ciernia3
1Department of Biochemistry and Molecular Biology, Djavad Mowafaghian Centre for Brain Health, University of British Columbia.
Journal of visualized experiments : JoVE
|October 2, 2023
概括
这项研究引入了一种新的流量细胞计方法,以快速测量全球基因组修饰. 这种技术允许对细胞和组织中的表观遗传变化进行高通量查.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 分子生物学分子生物学
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 基因表达受染色体结构和基因素后翻译修饰 (HPTMs) 的调节.
- HPTM 动态影响基因表达,作为抑制剂或激活剂.
- 目前的方法,如下一代测序,一次只分析一个HPTM,限制全面分析.
研究的目的:
- 开发一种高通量量化方法来评估全球HPTM.
- 为了在大规模基因组研究之前对基因组修饰进行查.
- 提供适用于各种蜂环境的多功能协议.
主要方法:
- 开发了一种基于流细胞计的协议来检测全球HPTMs.
- 该方法可以应用于培养细胞或从组织中分离的细胞.
- 实例数据显示,使用小鼠大脑中用脂多糖胺刺激的微质细胞来证明灵敏度.
主要成果:
- 开发的协议提供了全球HPTM的快速和定量测量.
- 该试验成功检测出全球HPTM在免疫刺激的反应中发生的变化.
- 该方法具有敏感性,适用于各种生物样本.
结论:
- 这种流式细胞计量协议为全球HPTM的高通量查提供了一个强大的工具.
- 该方法有助于研究各种细胞状态和刺激中的表观遗传调节.
- 它可以适应分析任何可通过抗体检测到的转录或表观遗传调节器.
