同时出现的本地和入侵的鱼物种外骨微生物群落的比较
Dorotea Grbin1, Sunčana Geček2, Anđela Miljanović3
1Faculty of Science, University of Zagreb, Rooseveltov trg 6, 10000 Zagreb, Croatia; Faculty of Food Technology and Biotechnology, University of Zagreb, Pierottijeva 6, 10000 Zagreb, Croatia.
Journal of invertebrate pathology
|October 2, 2023
概括
本地和入侵的鱼共享类似的外骨微生物,这表明潜在的微生物组混合. 这一发现对于理解生物入侵和制定本地物种保护战略至关重要.
科学领域:
- 生态生态学 生态生态学
- 微生物学 微生物学
- 侵入性物种 生物学 生物学
背景情况:
- 与宿主相关的微生物影响宿主健康和入侵物种的成功.
- 侵入性物种引入新的微生物,与本地生物群相互作用.
- 在鱼入侵中,外骨微生物群落的研究不足.
研究的目的:
- 将本地 (Pontastacus leptodactylus) 和入侵 (Pacifastacus leniusculus) 的外骨微生物群落进行比较.
- 研究息地和宿主物种对这些微生物群的影响.
- 评估已知病原体的存在.
主要方法:
- 外骨微生物群落的高通量16S rRNA测序. 外骨微生物群落的16S rRNA测序.
- 在物种之间对Amplicon序列变异 (ASV) 的比较分析.
- 使用滴滴数字PCR (ddPCR) 和定量PCR (qPCR) 检测特定病原体.
主要成果:
- 外骨微生物组是多样化的,受到环境的影响,并由蛋白质细菌主导.
- 本地和入侵鱼之间的ASV组成有显著差异,表明了特定物种的因素.
- 超过95%的细菌属在两种物种之间共享.
- 在这两种物种中检测到低水平的病原体Aphanomyces astaci和Saprolegnia parasitica.
- 一个非标准的ddPCR协议在低度病原体检测方面表现出卓越的性能.
结论:
- 鱼外骨架拥有多样化的微生物群落,由息地和宿主物种组成.
- 外骨微生物组的双向混合和同质化可能发生在本地和入侵物种之间.
- 这些发现为未来研究生物入侵期间的微生物组动态提供了基础.
