基于合成基因电路的测试与多级开关使得循环瘤DNA的无背景和绝对量化成为可能
Chao Zhang1,2, Zedong Li1,2,3, Jie Liu1,2
1The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology, Xi'an Jiaotong University, Xi'an 710049, P.R. China.
Research (Washington, D.C.)
|October 4, 2023
概括
我们开发了CATCH,这是一种用于无背景量化循环瘤DNA (ctDNA) 的新型试验. 这种方法精确测量ctDNA,推进瘤诊断和治疗监测.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 分子生物学分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 精确量化循环瘤DNA (ctDNA) 对癌症诊断和治疗至关重要.
- 现有的ctDNA检测试验面临背景噪声的挑战,限制了精度.
研究的目的:
- 开发一种新的测定方法,用于对ctDNA的无背景和绝对量化.
- 克服现有的ctDNA检测方法的局限性.
主要方法:
- 开发了一种称为CATCH的合成基因电路测试方法,利用多层切换器调节转录和翻译,从而消除背景噪声.
- 整合了基因电路与Cas9尼克酶H840A识别器和分子信标记者.
- 在35°C的单反应中实现了CATCH,并将其与数字CATCH的数字芯片集成.
主要成果:
- 在CATCH测试中,几乎没有背景噪声,这使得ctDNA的绝对量化能够得到充分的确定.
- 数字CATCH实现了精确的ctDNA量化.
- 在76名非小细胞肺癌患者的临床验证中,在检测耐药ctDNA突变方面显示出高灵敏度和特异性.
结论:
- CATCH是一种简单,强大和敏感的测试,用于无背景ctDNA检测和量化.
- 在临床环境中,CATCH试验显示出作为下一代ctDNA分析的强大工具的巨大潜力.
- 这项技术可以通过精确的ctDNA测量来改善瘤诊断和治疗监测.
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