通过使用孟德尔随机化和瘤空间转录组学来确定整体,侵袭性和早期前列腺癌的蛋白质组风险因素
Trishna A Desai1, Åsa K Hedman2,3, Marios Dimitriou2,3
1Cancer Epidemiology Unit, Oxford Population Health, University of Oxford, Oxford, United Kingdom.
medRxiv : the preprint server for health sciences
|October 4, 2023
概括
这项研究确定了与前列腺癌风险相关的20种蛋白质,包括与侵袭性和早期发病的新相关性. 这些发现突出了未来前列腺癌预防和治疗策略的蛋白质.
科学领域:
- 蛋白质组学和基因组学
- 癌症生物学 癌症生物学
- 遗传流行病学遗传流行病学
背景情况:
- 循环蛋白质在了解前列腺癌病因学方面发挥着至关重要的作用.
- 识别这些蛋白质可以揭示关键的生物学途径和癌症预防的新疗法标.
研究的目的:
- 研究基因预测的循环蛋白水平与整体,侵袭性和早期前列腺癌的风险之间的关联.
- 确定新的蛋白质生物标志物和前列腺癌的治疗点.
主要方法:
- 利用 cis-pQTL 门德尔随机化 (MR) 和局部化来分析 2,002 个基因预测的循环蛋白水平.
- 使用独立的前列腺癌基因组广泛关联研究 (GWAS) 在欧洲和非洲祖先队伍中复制的发现.
- 采用空间转录组数据来评估特定蛋白质在瘤攻击性中的作用.
主要成果:
- 确定了20种与前列腺癌风险遗传相关的蛋白质,其中14种与整体风险有关,7种与侵袭性疾病有关,8种与早期发病相关.
- 确认了PPA2,PYY,PRSS3,EHPB1,POGLUT3和TPM3等蛋白质与侵袭性或早期发生的前列腺癌的新相关性.
- 证明MSMB与所有形式的前列腺癌的反向关联,以及它在区分良性和高等级癌症组织中的作用.
结论:
- 蛋白质组学对于理解前列腺癌病因学和开发新型治疗干预措施至关重要.
- 对风险蛋白的功能分析对于理解临床攻击性至关重要.
- 确定了与侵袭性和早期前列腺癌相关的关键风险蛋白,用于未来的预防和治疗研究.
