从纵向测序中确定质瘤演变的预测因素
Quanhua Mu1,2, Ruichao Chai1,3,4, Bo Pang3,4
1Department of Chemical and Biological Engineering, Division of Life Science, State Key Laboratory of Molecular Neuroscience, Hong Kong University of Science and Technology, Hong Kong, SAR 999077, China.
Science translational medicine
|October 4, 2023
概括
扩散性质瘤的早期分子变化预测癌症的演变和治疗耐药性. 在诊断时的MYC放大通过促进高突变驱动着temozolomide耐药性,从而提供了新的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 癌症 演化 演化 癌症 演化
背景情况:
- 克隆进化是癌症进展和质瘤治疗耐药性的关键驱动因素.
- 了解引导治疗后癌症演变的早期分子特征至关重要,但仍然不清楚.
研究的目的:
- 识别成年扩散性质瘤中瘤演变的早期分子预测因素.
- 开发一个预测模型来预测质瘤的演变和患者分层.
- 阐明MYC影响治疗耐药性和高突变的机制.
主要方法:
- 测序和临床数据的多变量分析来自544个最初复发的成人扩散质瘤对.
- 开发和验证机器学习模型CELLO2 (长度数据癌症演变2版本).
- 在体外实验中使用质瘤细胞系和患者衍生的质球来研究temozolomide耐药性和MYC功能.
主要成果:
- 在IDH突变性质瘤中,CDKN2A缺失预测了晚期瘤缩;在IDH野生型质瘤中,Ki67预测了高突变.
- 在诊断时,MYC增益或MYC目标激活预测了所有质瘤亚型中的治疗诱导的高突变.
- CELLO2模型对患者进行了分层,确定了一个高风险组,MYC增长和生存率差.
- MYC通过增加不匹配修复基因的脆弱性来促进高突变来驱动temozolomide耐药性.
结论:
- 早期的分子事件,特别是MYC变化,是扩散性质瘤进化和治疗耐药性的重要预测因素.
- CELLO2模型为预测质瘤进展和分层患者进行精确瘤学提供了一个工具.
- 准MYC驱动的超变是一种潜在的策略,可以克服质瘤中temozolomide耐药性.
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