在膀过渡性细胞癌中识别枢纽基因,通过CERNA网络构建,与基因网络分析集成
Hai Wang1, Lei Gao2, Yin Chen2
1Department of Oncology, The Affiliated Jintan Hospital of Jiangsu University, Changzhou, China.
Journal of cellular and molecular medicine
|October 5, 2023
概括
研究人员使用网络分析确定了膀过渡细胞癌 (BTCC) 中的关键基因. 这些发现可能会导致这种常见癌症的新诊断生物标志物和治疗方法.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 膀过渡性细胞癌 (BTCC) 占膀癌的90%以上.
- 由于缺乏有效的查生物标志物,早期诊断和治疗具有挑战性.
研究的目的:
- 识别BTCC发生和进展中的潜在枢纽基因和监管途径.
- 研究用于早期诊断和治疗目标的生物标志物.
主要方法:
- 使用TCGA数据集进行权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 和竞争性内源RNA (ceRNA) 网络构建.
- 实时聚合酶链反应 (RT-PCR) 用于基因表达验证.
- 生存分析以将基因模块与预后相关联.
主要成果:
- 一个11基因共同表达模块与BTCC瘤阶段和预后显著相关.
- 确定了与整体存活率相关的特定调节轴 (AC112721.1/LINC00473/AC128709.1-hsa-mir-195-RECK和LINC00460-hsa-mir-429-ZFPM2) 的相关性.
- 发现AKAP12在BTCC瘤组织中受到下调.
结论:
- 已确定的枢纽基因和监管网络为BTCC诊断和治疗提供了潜在的目标.
- 对这些生物标志物的进一步研究可以改善膀癌患者的治疗结果.
