开发一种图像处理软件,用于量化组织学化染色图像
Xinrui Li1, Yau Tsz Chan2,3,4,5, Yangzi Jiang2,3,4,5,6
1School of Medicine, Northwest University, Xi'an, Shaanxi, China.
PloS one
|October 5, 2023
概括
一个新的染色量化 (SQ) 工具准确地量化组织学图像,即使有噪音或不必要的染色. 该软件的性能优于生物医学研究中复杂的成像场景的现有方法.
科学领域:
- 生物医学研究的研究.
- 数字病理学数字病理学
- 图像分析 图像分析
背景情况:
- 组织学染色图像对于生物医学研究至关重要.
- 现有的量化工具与噪音或不必要的污点作斗争,假设干净的背景.
- 复杂的染色场景,包括反染色和脏的染色,对当前的方法构成挑战.
研究的目的:
- 开发一个染色量化 (SQ) 工具,用于准确的组织学图像分析.
- 创建软件,能够去除与感兴趣区域 (ROI) 混合的不需要的污点.
- 解决当前工具在处理复杂和杂的组织学图像方面的局限性.
主要方法:
- 开发了一种名为"染色量化" (SQ) 的轻度软件工具.
- 采用高阶统计转换和局部密度过作为核心算法.
- 使用内部组织学图像 (Alizarin Red和Von Kossa) 和外部数据集验证了该工具.
主要成果:
- 与Otsu和Triclass的值方法相比,SQ工具显示出更高的性能.
- 与ImageJ.相比,在面积和强度测量中,平均平均差异低于0.05%的平均差异.
- 在各种染色类型和验证批次的测量中表现出超过0.8的成功率.
结论:
- 染色量化 (SQ) 工具是用于自动组织学染色图像量化的强大解决方案.
- 该软件有效地处理复杂的场景,包括不需要的污点和弱信号.
- 在具有挑战性的条件下,SQ提供准确可靠的测量,在具有挑战性的条件下表现优于既定方法.
