一项试点研究,研究机器学习对Ph阳性急性淋巴细胞白血病成年人异性干细胞移植后复发预测的影响
Kseniia S Afanaseva1, Evgeny A Bakin2, Anna G Smirnova2
1Department of Bone Marrow Transplantation of Adults, RM Gorbacheva Research Institute, Pavlov University, Lev Tolstoy Str., 6/8, Saint-Petersburg, Russia, 197022. afanasevaksenya11@gmail.com.
Scientific reports
|October 5, 2023
概括
机器学习准确地预测了干细胞移植后费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病 (Ph+ ALL) 的复发风险. 低BCR::ABL1水平 (<0.06%) 与慢性移植对宿主疾病表明复发风险低.
科学领域:
- 血液学 血液学 血液学
- 在瘤学瘤学.
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 在费城的移植后复发染色体阳性急性淋巴细胞白血病 (Ph+ ALL) 显著增加死亡风险.
- 预测工具是指导预防策略和管理复发风险的关键需求.
- 全基性造血干细胞移植 (allo-HSCT) 是Ph+ALL的关键治疗方式.
研究的目的:
- 开发和验证一种机器学习模型,用于预测Ph+ALL患者移植后复发风险.
- 为了确定继 allo-HSCT 后复发的关键预测因素,结合氨酸激酶抑制剂 (TKI) 预防.
- 建立明确的BCR::ABL1值来分层复发风险.
主要方法:
- 74名Ph+ALL患者的回顾性分析,这些患者接受了allo-HSCT.
- 应用各种机器学习算法,包括渐变增强机 (GBM),以使用串行BCR::ABL1水平和临床变量来建模复发风险.
- 使用曲线下的面积 (AUC) 和移植后不同时间点的错误率来评估模型性能.
主要成果:
- GBM模型表现出卓越的性能,最大AUC为0.91.
- 确定的主要预测因素是BCR::ABL1水平 (移植前和移植后),预测时间点和慢性移植对宿主疾病 (GvHD).
- 该模型在移植后的+100日后实现了<22%的错误率;在+100日之前的预测不那么准确.
- 慢性GvHD患者的BCR::ABL1水平<0.06%预测复发风险较低.
- 没有慢性GvHD的患者被归类为高风险患者,无论BCR::ABL1水平如何.
结论:
- 在Ph+ALL中,GBM模型有效地预测了Ph+ALL的allo-HSCT后复发风险,即使使用TKI预防.
- 当前的BCR::ABL1水平与GvHD状态相结合,可以将患者分类为复发的低风险或高风险类别.
- 进一步验证这种机器学习方法是有必要的,以改进临床决策.
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