在RiPP酶异构复杂结构的指导下,发现了一种细菌氨酸α-N-甲基化的天然产物

科学领域:

• 自然产品化学 自然产品化学
• 微生物学 微生物学
• 生物化学 生化学

背景情况:

• 蛋白是一种由核糖体合成和翻译后修饰的天然产物 (RiPPs) 的类,其特点是胺骨干甲基化.
• 之前已经在细菌中确定了1500多个假定的玻素通路,但没有一个与已知的二次代谢物有关.
• 大多数细菌氨酸的生物学作用和身份仍然难以捉摸.

研究的目的:

• 为了识别和表征一种特定的细菌素天然产品.
• 为了阐明一种新型的生物合成途径和成熟过程.
• 建立生物信息学预测的氨酸通路与实际的二次代谢产物之间的联系.

主要方法:

• 在 *Shewanella oneidensis* MR-1.中深入描述玻素通路.
• 创建和分析前体变体.
• 对前体和甲基转移酶复合物的晶体检查.
• 蛋白酶测定和对淘汰和过度表达菌株进行蛋白质成熟的比较分析.

主要成果:

• 标识shewanellamide A,一种新型的细菌衍生素天然产品.
• 谢瓦尼拉胺A是一种16-mer线性,具有两个骨干甲基化.
• 该研究证实了代谢物的蛋白质分解成熟边界.

结论:

• 谢万内拉胺A代表了少数已识别的氨酸代谢产物之一,也是从细菌中发现的第一个.
• 这项工作将一种特定的细菌二次代谢物与更广泛的酸类联系起来.
• 这些发现为了解细菌中的蛋白多样性和功能提供了基础.