公共卫生参考实验室对COVID-19大流行病的快速反应

科学领域:

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背景情况:

• 巴西在COVID-19大流行期间面临重大挑战,圣保罗是受影响最严重的州.
• 圣保罗的参考实验室阿道尔福·卢茨研究所 (IAL) 需要扩大其对SARS-CoV-2的诊断能力.
• 在新出现的流行病期间,公共卫生实验室的快速响应能力存在关键差距.

研究的目的:

• 详细介绍IAL-2的实施和设计,这是一个二级诊断设施.
• 在 IAL-2 分析 COVID-19 的 RT-qPCR 测试在 IAL-2 的表现.
• 为了将RT-qPCR结果与在圣保罗州疑似的SARS-CoV-2病例相关联.

主要方法:

• 在IAL-2测试的疑似SARS-CoV-2病例的二次数据的回顾性分析.
• 研究期:2020年4月1日至2022年3月8日.
• 评估RT-qPCR测试结果,包括各种套件的周期值 (Ct).

主要成果:

• 在巴西首例COVID-19病例发生一个月后,IAL-2开始运行,并进行了304,250次RT-qPCR测试.
• 阳性结果占测试的32.3% (98,319),其中67.7% (205,827) 是负面的,0.03% (104) 是不确定的.
• 大约79.7%的阳性样本显示RT-qPCRCt值≤30对于E/N基因.

结论:

• IAL成功建立了一个新的实验室结构 (IAL-2),以管理大量的COVID-19诊断样本.
• 快速实施证明了使用各种RT-qPCR协议保持诊断质量的有效策略.
• 这一举措强调了在流行病期间可适应的公共卫生实验室基础设施的重要性.