使用靴盖进行集体土壤采样,与从商业罗曼田中采集的土壤采样相比,显示了类似的指标生物和微生物社区恢复
Jiaying Wu1, Rachel J Gathman1, Jorge Quintanilla Portillo1
1Department of Food Science and Human Nutrition, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL 61801, USA.
Journal of food protection
|October 7, 2023
概括
集体靴盖采样有效捕获土壤微生物,类似于传统的抓取样本以确保产品安全. 这种方法对未来在农业土壤中检测食源性病原体充满希望.
科学领域:
- 农业微生物学 农业微生物学
- 食品安全科学 食品安全科学
- 土壤科学 土壤科学
背景情况:
- 收获前生产的土壤测试对于确保食品安全至关重要.
- 传统的采集采样方法可能不能完全代表土壤微生物群体.
- 集体靴盖采样提供了一个潜在的更全面的方法,通过从更大面积收集土壤.
研究的目的:
- 为了比较集体靴盖采样与传统抓取采样方法的有效性.
- 评估靴盖采样是否准确地反映了质量和安全指标生物和微生物群落多样性.
- 评估靴盖采样对于未来的食品传播病原体检测的适用性.
主要方法:
- 从罗马菜田中采集了土壤样本,使用三种方法:聚合靴盖,复合抓取和高分辨率抓取.
- 氧化板数 (APC) 和大肠杆菌总数被计算出来.
- 微生物社区的多样性使用16SrRNA测序进行了分析.
主要成果:
- 空气板计数在采样方法之间没有显著的生物差异.
- 与抓取样本相比,靴盖采样恢复了明显更多的总 coliforms.
- 16S rRNA测序显示,α多样性没有显著差异,但方法之间的β多样性有显著差异,检测到的类和属有很高的重叠.
结论:
- 集体靴盖采样与抓取采样相似,用于恢复关键微生物指标和代表性土壤微生物群.
- 这些发现支持使用聚合靴盖采样作为收获前土壤测试的可行方法.
- 需要进一步的研究来探索其在检测食物传播病原体中的应用.


