多实验室验证报告用于使用qPCR验证和亚型化Listeria monocytogenes
Ruiqing Pamboukian1, Martine Ferguson2, Karen Jarvis3
1Office of Regulatory Affairs, U.S. FDA, Rockville, MD, USA.
Journal of food protection
|October 8, 2023
概括
多实验室验证证实,一个qPCR方法可靠地识别出Listeria monocytogenes (Lm) 和它的血清组,准确度很高. 这种快速,高通量方法通过快速检测污染事件来提高食品安全.
科学领域:
- 食品安全 食品安全
- 微生物学 微生物学
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 李氏菌 (Listeria monocytogenes,Lm) 引起严重的侵袭性李氏菌病,需要迅速检测和鉴定,以保护公共健康.
- 传统的LM识别和血清分组方法耗时,阻碍了对食品污染的及时反应.
研究的目的:
- 进行量化聚合酶链反应 (qPCR) 方法的多实验室验证,以快速识别和血清分组Lm分离物.
- 在多个独立实验室中评估qPCR方法的可靠性,敏感性,特异性和准确性.
主要方法:
- 16个实验室独立分析了一个由43个李斯特菌分离物 (包括Lm和其他李斯特菌种) 和3个对照菌株组成的盲目小组,使用已建立的qPCR方法.
- 该小组包括六个Lm血清组的代表 (2A,2B,2C,4B,NT和4bV/IVb-v1).
- 分析了序列读取档案 (SRA) 文件,以确定潜在的非典型血清组形状.
主要成果:
- 在参与实验室中,qPCR方法表现出高灵敏度,特异性和准确性 (一般≥97%),用于基因-物种识别和血清分组.
- 一个实验室报告说,对于非李斯特菌的识别,敏感度略低 (93%).
- 在SRA数据中发现了低百分比 (0.30%) 的非典型qPCR血清组,与LM系II一致.
结论:
- 多实验室验证证实,qPCR方法是快速准确识别和血清分组Listeria monocytogenes的可靠工具.
- 与传统技术相比,这种方法在减少动手时间和增加吞吐量方面具有显著的优势.
- 这种经过验证的qPCR方法提高了对食品工业中Lm污染事件的快速反应能力,从而提高了食品安全.
