在植物流细胞计中对仪器设置和原始数据分析的最佳实践
Petr Koutecký1, Tyler Smith2, João Loureiro3
1Department of Botany, Faculty of Science, University of South Bohemia, České Budějovice, Czechia.
概括
标准化流式细胞计量 (FCM) 方法可确保可靠的植物化和基因组大小测量. 本指南详细介绍了工厂FCM中仪器设置和数据分析的最佳实践.
科学领域:
- 植物科学 植物科学
- 细胞计量 (cytometry) 是一种细胞计量方法.
背景情况:
- 流细胞计 (flow cytometry,FCM) 是确定植物化水平和基因组大小的主要方法.
- 标准化和遵守最佳实践对于在工厂中可靠和可重复的FCM测量至关重要.
研究的目的:
- 为植物科学中流动细胞计量最佳实践提供全面的概述.
- 引导研究人员标准化方法,以准确确定 ploidy 和基因组大小.
主要方法:
- 讨论仪器校准和质量控制程序.
- 详细检查仪器和采集设置 (参数,流量,事件计数,尺度,区分器,峰值位置).
- 原始数据分析方法的描述和比较:网关和直方图建模.
主要成果:
- 仪器和采集设置对数据质量和下游分析产生重大影响.
- 网关和直方图模型都对原始数据分析具有明显的优点和缺点.
结论:
- 遵守仪器设置和数据分析的标准化协议对于可复制工厂FCM至关重要.
- 实施推的最佳实践,将提高植物的化和基因组大小数据的可靠性.
