使用Metataxonomics监测污水污泥中的潜在致病原体
Nicolas Rozo-Montoya1, Katherine Bedoya-Urrego1, Juan F Alzate1,2,3
1Centro Nacional de Secuenciación Genómica CNSG, Sede de Investigación Universitaria-SIU, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia.
Food and waterborne parasitology
|October 9, 2023
概括
在哥伦比亚的污水泥中检测到肠道寄生虫DNA,包括致病物种,如Giardia intestinalis和Entamoeba histolytica. 污水处理厂在处理过的水和生物固体中排放了寄生虫DNA.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 分子寄生虫学 分子寄生虫学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 肠道寄生虫是一个全球性的健康问题,特别是对于儿童来说.
- 通过水和土壤的环境污染有助于寄生虫的传播.
- 在环境样本中检测寄生虫历来是困难的.
研究的目的:
- 用先进的测序来检测和分类污水污泥中的原生态DNA.
- 分析废水处理厂流入,废水和生物固体中的寄生虫DNA.
- 了解废水处理系统中的寄生虫DNA动态.
主要方法:
- 基因组的基因组学和遗传学分析.
- 下一代测序 (NGS) 用于寄生虫检测.
- 从哥伦比亚两座城市采集了污水污泥,流入,废水和生物固体的样本.
主要成果:
- 检测人类病原性寄生虫,包括Giardia intestinalis,Entamoeba histolytica和Blastocystis sp. 在内. 在所有污泥样本中.
- 与废水相比,废水中的寄生虫DNA度较高.
- 在经过处理的废水和生物固体中检测到致病寄生虫DNA.
结论:
- 污水污泥是致病性肠道寄生虫DNA的储存库.
- 废水处理过程并不能完全消除寄生虫DNA.
- 使用NGS进行环境监测对于监测寄生虫污染至关重要.
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