狗和人类骨髓瘤瘤微环境的大规模比较解卷分析揭示了保存的临床相关亚型
Sushant Patkar1, Josh Mannheimer2, Stephanie Harmon1
1Artificial Intelligence Resource, Molecular Imaging Branch, National Cancer Institute, NIH, Bethesda, MD, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|October 9, 2023
概括
狗骨髓瘤 (骨癌) 亚型显示保存的瘤微环境 (TME),可预测人类患者的结果. 这项研究强调了犬类作为发现骨髓瘤新生物标志物的有价值模型.
科学领域:
- 比較瘤學 的相關搜尋
- 癌症基因组学 癌症基因组学
- 瘤微环境研究 研究
背景情况:
- 骨髓瘤是一种具有攻击性的骨癌,缺乏有效的生物标志物.
- 狗骨肉瘤与人类疾病有相似之处,提供了一个翻译模型.
- 了解瘤微环境 (TME) 对癌症的进展和治疗至关重要.
研究的目的:
- 在狗骨髓瘤中识别基于瘤微环境 (TME) 的亚型.
- 在狗中描述TME从原发性到转移性骨髓瘤的演变.
- 评估狗骨髓瘤TME亚型对人类患者的转化潜力.
主要方法:
- 分析了来自213个原发性和100个转移性犬骨肉瘤样本的大量转录组数据.
- 鉴定了三种不同的基于TME的亚型:免疫丰富 (IE),免疫丰富的密集的细胞外矩阵 (IE-ECM) 和免疫沙漠 (ID).
- 对犬类和人类骨髓瘤的转录数据进行比较分析.
主要成果:
- 三种犬类骨髓瘤TME亚型表现出不同的细胞组成,瘤性通路活性和染色体不稳定性.
- 该研究在临床环境中描述了骨髓瘤进展期间的TME演变.
- 基于犬类TME的亚型在人类中保留,并预测人类患者的无进展生存,独立于其他预后因素.
结论:
- 狗骨肉瘤可以作为研究人类瘤微环境的强大模型.
- 在狗中发现的基于TME的亚型在临床上与人类骨髓瘤有关.
- 这项研究确定了新的,可翻译的生物标志物,用于骨髓瘤患者分层和结果预测.
