在韩国的杜洛克,兰德雷斯和约克郡猪的乳头数量上使用单步方法进行全基因组关联研究

科学领域:

• 动物遗传学和动物基因组学
• 量化遗传学 量化遗传学
• 牲畜中的生殖生物学

背景情况:

• 播种乳数量是影响幼大小和生殖效率的关键特征.
• 了解乳头数的遗传基础对于猪的遗传改进计划至关重要.
• 之前的研究已经表明乳头数的遗传成分,但具体的遗传标记仍然需要完全阐明.

研究的目的:

• 研究三种主要猪品种 (杜洛克,兰德雷斯,约克郡) 乳头数量的遗传结构.
• 为了确定特定的染色体区域和与乳头数量变异相关的候选基因.
• 评估已识别的基因标记物在养猪中对基因组选择的潜力.

主要方法:

• 使用猪SNP60K珠芯片对20353头猪进行基因定型.
• 从三种品种的240,603头猪身上进行了表型数据分析.
• 全基因组关联研究 (GWAS) 以检测SNP和乳腺数之间的显著关联.

主要成果:

• 总乳头数量的遗传概率估计在各种品种中从0.33到0.51不等.
• 在多个染色体上发现了与乳头数量的显著关联,SSC7在所有品种中尤为突出.
• 位于VRTN和SYNDIG1L基因之间的MARC0038565标记物显示出最强的关联,并且在所有品种中都是显著的. 建议VRTN基因作为候选基因. 在兰德雷斯猪和约克郡猪的AREL1和LTBP2基因中也发现了显著的标记物.

结论:

• 这项研究阐明了猪乳头数量的遗传基础,强调SSC7作为一个主要区域.
• VRTN基因被确定为调节乳头数量的强有力的候选者.
• 鉴定的标记物和区域,特别是SSC7上,代表了基因组选择的有价值目标,以提高猪的生殖表现.