评估pH对牛β-乳糖球蛋白和阿弗拉托克素M1之间的复合形成的影响:一个分子动态模拟和分子对接研究
Jiménez-Pérez Carlos1, Gómez-Castro Carlos2, Alatorre-Santamaría Sergio1
1Departamento de Biotecnología, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa, México, México.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|October 11, 2023
概括
这项研究表明,在酸性pH (4.0) 时,阿弗拉托辛M1 (AFM1) 在Calyx腔中与β-乳糖球蛋白 (β-LG) 结合更强. 这一发现解释了奶酪生产过程中AFM1的变异性,特别是在酸性凝固过程中.
科学领域:
- 食品科学 食品科学 食品科学
- 生物化学 生物化学
- 计算化学计算化学
背景情况:
- 非洲毒素M1 (AFM1) 是一种在乳制品中发现的真菌毒素,其在奶酪生产过程中的变异性尚未完全理解.
- β-乳糖球蛋白 (β-LG) 是一种主要的乳清蛋白,有可能结合AFM1.1.
研究的目的:
- 研究AFM1与β-LG在不同pH值 (4.0和6.5) 的结构模型之间的相互作用.
- 阐明AFM1与β-LG结合的基础分子机制,并解释奶酪生产中的AFM1变异性.
主要方法:
- 用分子动力学 (MD) 模拟来优化β-LG模型并观察形状变化.
- 用分子对接来确定β-LG-AFM1复合体的结合自由能量 (ΔG).
主要成果:
- 在pH 4.0时,β-LG的Calyx腔表现出开放的构造,导致一个更稳定的复合体与AFM1 (ΔG = -42.6 kJ mol-1).
- 在pH 6.5时,Calyx腔保持封闭,导致一个不太稳定的复合物 (ΔG = -32.0 kJ mol-1).
- 在C位和二聚体接口的结合亲和度没有显著的pH取决于差异.
结论:
- 计算分析表明,AFM1在酸性条件下 (pH4.0) 在腔中与β-LG形成更稳定的复合体.
- 在酸性pH值下这种增强的结合亲和力表明,乳清蛋白在奶酪生产中的酸性凝结过程中更容易结合AFM1,这有助于真菌毒素的变异性.
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