多基因组学和生物信息学在感染Toxoplasma gondii的蒙面棕花的大脑中识别出差异表达的效应因子

科学领域:

• 兽医寄生虫学 兽医寄生虫学
• 分子生物学分子生物学
• 病原体传播动态 病原体传播动态

背景情况:

• 蒙面棕 (Paguma larvata) 是已知的传染病原体的存储库,例如Toxoplasma gondii向人类传播.
• 在蒙面棕中T. gondii感染的特定病原体仍然在很大程度上未被探索.
• 了解这些分子变化对于公共卫生和兽医至关重要.

研究的目的:

• 为了研究长期感染T. gondii. 的蒙面棕鸟脑组织中的分子变化.
• 在受感染的白大脑中识别不同表达的蛋白质和相关的信号通路.
• 探索T. gondii感染与癌症相关途径之间的潜在联系.

主要方法:

• 使用iTRAQ和生物信息学进行蛋白质组分析,以确定大脑组织中差异表达的蛋白质.
• 整合转录基因和蛋白质基因数据以识别共同表达的基因.
• 西方斑块和免疫组织化学验证关键蛋白质表达.
• 生物信息分析包括KEGG通路分析,免疫透分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析.
• 利用癌症数据库 (TCGA,GEPIA) 与人类癌症类型和预后相关联基因表达.

主要成果:

• 总共有268种不同表达的蛋白质被确定,其中111种是上调的,157种是下调的.
• 凯格分析显示,PI3K-Akt信号传递,癌症相关途径和免疫信号传递等途径的丰富程度显著.
• 24个基因在mRNA和蛋白质水平上都表现出差异性表达,包括REEP3,REEP4,TEP1和EEPD1.
• 发现这些基因在各种人类癌症中被上调,包括质母细胞瘤.
• 在质母细胞瘤患者的预后分析表明,REEP3和EEPD1表达与更好的结果相关,而REEP4和TEP1与更差的结果相关.

结论:

• 托克索普拉斯马淋巴菌感染诱导了面具棕的大脑显著的分子变化.
• 鉴定出差异表达的基因和通路与免疫反应和癌症发展有关.
• 这些发现为T. gondii感染的发病过程提供了洞察力,并为癌症研究提供了潜在的生物标志物.