pi_tailtrack:一个紧的,廉价的,开源的,用于头戴头套斑马鱼的行为跟踪系统
1Laboratoire MeLiS, Université Claude Bernard Lyon 1 - CNRS UMR5284 - Inserm U1314, Institut NeuroMyoGène, Faculté de Médecine et de Pharmacie, 8 Avenue Rockefeller, 69008 Lyon, France.
The Journal of experimental biology
|October 11, 2023
概括
本研究介绍了一种低成本的Raspberry Pi系统,用于在显微镜下跟踪幼虫斑马鱼的行为. 它可以精确量化游泳模式,将神经活动与行为联系起来.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 生物工程是生物工程.
- 斑马鱼的研究研究
背景情况:
- 准确量化动物行为对于将神经活动与行为输出相关联至关重要.
- 头部受限幼虫斑马鱼是研究神经回路和行为的关键模型生物.
研究的目的:
- 开发和描述一个负担得起的,高性能的成像和追踪系统,用于头部住的幼虫斑马鱼.
- 为了实现与功能显微镜技术兼容的实时行为分析.
主要方法:
- 使用Raspberry Pi计算机,Pi NoIR相机和开源软件进行实时图像处理.
- 实现了尾部细分和骨架化算法,用于100Hz以上的斑马鱼幼虫追踪.
- 设计了一个用于精确,长期量化游泳行为的系统.
主要成果:
- 该系统成功地实现了对幼虫斑马鱼尾部运动的实时,高频跟踪.
- 证明了在长时间内精确量化游泳行为的能力.
- 开发的系统与功能显微镜兼容,用于关联神经活动和行为.
结论:
- 该系统提供了一个简单而有效的解决方案,用于量化头部受限幼虫斑马鱼的行为.
- 低成本 (340欧元) 使这个系统可供许多研究实验室使用.
- 促进了游泳行为的详细分析,这对于理解运动的神经控制至关重要.
