在使用临床可行的生物标志物测定方法确定的固体瘤基因组中,DDR基因突变,TMB和PD-L1之间的关系
Danyi Wang1, Brian Elenbaas2, Karthikeyan Murugesan3
1Clinical Measurements Sciences, Global Research & Development, EMD Serono Research & Development Institute, Inc., an affiliate of Merck KGaA, Billerica, MA, USA.
NPJ precision oncology
|October 11, 2023
概括
特定的DNA损伤反应 (DDR) 基因突变,如SWI/SNF基因中的突变,与较高的瘤突变负担 (TMB) 有关. 然而,DDR突变很少与PD-L1表达相关,突出显示它们在免疫治疗中的独立作用.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫治疗是一种免疫疗法.
背景情况:
- DNA损伤反应 (DDR) 途径对于DNA修复和细胞生存至关重要.
- 激活DDR基因中的失活突变可以提高瘤突变负担 (TMB),这是抗PD-1/PD-L1免疫疗法的生物标志物.
- 了解DDR突变,TMB和PD-L1表达之间的相互作用对于优化癌症治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 确定临床可操作的DDR基因中基因组变化的频率.
- 在各种癌症类型中调查DDR基因突变,TMB和PD-L1表达之间的关联.
- 澄清TMB和PD-L1表达之间的关系,作为免疫治疗的预测生物标志物.
主要方法:
- 使用FoundationInsights®网络门户进行基因组数据分析.
- 在选择的DDR基因中分析了突变频率 (例如,不匹配修复,POLE,SWI/SNF,ATR).
- 在膀,结直肠,非小细胞肺癌,卵巢癌和前列腺癌中评估了DDR突变,TMB水平和PD-L1表达之间的关联.
主要成果:
- 确认了不匹配修复和高TMB的POLE突变之间的已知关联.
- 在多种癌症类型中确定了SWI/SNF基因突变 (ARID1A,SMARCA4) 和高TMB之间的显著联系.
- 在结直肠和前列腺癌中发现与高TMB相关的ATR突变.
- 观察到单个DDR突变与高PD-L1表达之间的关联是罕见的,癌症特异的.
- 显示了高TMB和高PD-L1表达之间的弱相关性,表明它们的不同角色.
结论:
- 特定的DDR基因突变,特别是在SWI/SNF和ATR中,与各种癌症的TMB增加有关.
- 个别的DDR突变对PD-L1表达的预测价值有限.
- 高的TMB和高的PD-L1表达在很大程度上是预测对免疫检查点抑制剂反应的独立生物标志物.
