从网络分析到实验验证:识别非肌肉肌素II收缩性的调节剂,使用折叠性消化信号通路
Andy Zhao1, Sophia Varady1, Madelyn O'Kelley-Bangsberg1
1Reed College Department of Biology, 3203 SE Woodstock Blvd, Portland, OR, 97202, USA.
研究人员发现了顶收缩的新型调节剂,这是发育过程中至关重要的过程. 通过计算互动组方法,他们发现了Flapwing和CG11811蛋白调节Drosophila的非肌肉肌素II活性.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 细胞生物学 细胞生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 尾收缩是一个基本的形态遗传过程,对于形成多细胞生物体中复杂的细胞模式至关重要.
- 非肌肉肌肉蛋白II (NMII) 通过收缩上皮细胞的顶部域来驱动顶部收缩.
- 德洛索菲拉 (Drosophila Folded-gastrulation (Fog)) 路径,涉及雾,雾和烟雾,是研究顶峰收缩和NMII激活的良好特征系统.
研究的目的:
- 为了确定雾诱导的顶尖收缩途径的新型蛋白调节剂.
- 探索以前未被描述的蛋白质在NMII产生的收缩性中的潜在作用.
主要方法:
- 从高通量实验数据构建了一个全面的Drosophila蛋白质-蛋白质相互作用网络 (互动组).
- 应用基于图形的算法来从相互作用体中预测候选NMII调节器.
- 使用RNA干扰 (RNAi) 和在Drosophila S2R+细胞中进行细胞收缩性试验的实验验证.
主要成果:
- 一项计算互原子分析预测了14种参与雾信号的候选蛋白.
- RNAi查发现了两种新型调节剂:血清/氨酸酸酶Flapwing和假定酸酶CG11811.
- 耗尽Flapwing和CG11811抑制了细胞收缩性,这表明它们在雾途径中的调节作用.
结论:
- 飞翼和CG11811是Drosophila中雾介导的顶尖收缩通路的新型调节者.
- 这些发现扩大了我们对在发育过程中控制NMII活动的分子机制的理解.
- 这项研究强调了交互原子网络分析对于发现信号通路中的新组件的有用性.
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