组织特异性转录组和代谢组分析揭示了药用植物Schisandra sphenanthera中林生物合成的候选基因
Boshi Sun1, Peng Wang1, Meng Guan2
1College of Life Science, Northwest A & F University, No. 22 Xinong Road, Yangling, 712100, Shaanxi, China.
BMC genomics
|October 11, 2023
概括
在四种组织中使用转录组和代谢组分析研究了schisandra sphenanthera药用细菌. 确定了关键的基因和转录因子,涉及联生物合成,特别是在水果和根.
科学领域:
- 植物生物化学和分子生物学
- 药用植物基因组学 药用植物基因组学
- 代谢学和转录学.
背景情况:
- 斯基桑德拉 (Schisandra sphenanthera) 是一种重要的药用植物,其主要化合物是生物活性类.
- 虽然最喜欢水果,但其他组织如根,茎和叶子仍然未得到充分利用.
- 了解素代谢途径对于优化这种植物的使用至关重要.
研究的目的:
- 为了阐明在斯基桑德拉斯菲南特拉的类代谢途径.
- 为了确定关键的基因和转录因子,调节不同组织的灵生物合成.
- 为了比较水果,根,茎和叶子中的干分布和基因表达.
主要方法:
- 对四种主要的S. sphenanthera组织进行了转录组和代谢组分析.
- 进行了组织特异性基因表达和转录因子分析.
- 使用权重基因共同表达网络分析来识别关键的调节基因.
主要成果:
- 已经确定了超过1.67亿个转录和9100万个单基因.
- 根组织显示独特的单基因的数量最高 (9703),而叶子的数量最低 (189).
- 基因被首选丰富于水果和根,特定的基因 (例如,MYB,bHLH,ERF) 参与了它们的调节.
结论:
- 转录基因组和代谢数据为研究S. sphenanthera中的干生物合成提供了基础.
- 已识别的PAL1,C4H-2和MYB18等基因对果实中联积累具有潜在的关键.
- 像CCR5,SDH4和ERF7这样的基因可能在根部内联积累中起作用.
