在HCC患者中对CLOCK,BMAL1,CRY1,CRY2,PER1,PER2,PER3和NPAS2蛋白质的基因变化的生物信息分析
Durmus Ayan1,2, Ak Cagatay3
1Department of Medical Biochemistry, Nigde Training and Research Hospital, Nigde, Turkiye.
Hepatology forum
|October 12, 2023
概括
研究肝癌 (HCC) 中的昼夜节律基因揭示了突变和改变表达. 特定的基因变化,如PER1和CRY2,与患者的存活率相关,提供潜在的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 遗传学是一种遗传学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 循环节律基因调节重要的生物过程.
- 肝细胞癌 (HCC) 涉及复杂的遗传改变.
- 了解HCC中昼夜基因概况对于向治疗至关重要.
研究的目的:
- 在HCC中全面分析核心昼夜节律基因的突变和mRNA配置文件.
- 在HCC患者中确定昼夜基因表达和整体存活 (OS) 之间的关联.
主要方法:
- 通过cBioPortal利用癌症基因图集 (TCGA) 数据库对369名HCC患者进行基因分析.
- 使用多形态表型化v2,突变评估器和SIFT评估突变效应.
- 确定基因与基因的关联与GeneMANIA和OS相关性与卡普兰-梅尔分析.
主要成果:
- 在核心昼夜基因中共发现了25种突变.
- 减少PER1,PER3和CRY2的表达,与较短的OS相关 (p <0.05).
- 增加的PER2表达与较长的OS相关 (p=0.045),而增加的NPAS2表达与较短的OS相关 (p=9e-04).
结论:
- 在PER1,PER2,CRY2和NPAS2基因的改变与HCC患者的结果有显著的关联.
- 这些特定的昼夜基因代表了HCC治疗策略的潜在分子标,包括化疗和免疫疗法.


